Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C20orf78Q9BR46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf78Q9BR46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C20orf78Q9BR46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C20orf78Q9BR46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms