Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF4Q9BQW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF4Q9BQW3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF4Q9BQW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF4Q9BQW3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms