Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED2Q99967 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CITED2Q99967 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED2Q99967 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms