Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCA3Q99758 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCA3Q99758 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCA3Q99758 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCA3Q99758 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCA3Q99758 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCA3Q99758 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms