Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A3Q99624 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A3Q99624 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A3Q99624 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A3Q99624 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A3Q99624 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 448.7 ms