Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POP1Q99575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POP1Q99575 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POP1Q99575 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POP1Q99575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POP1Q99575 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POP1Q99575 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POP1Q99575 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POP1Q99575 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POP1Q99575 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POP1Q99575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POP1Q99575 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POP1Q99575 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POP1Q99575 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POP1Q99575 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POP1Q99575 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POP1Q99575 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POP1Q99575 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POP1Q99575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POP1Q99575 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POP1Q99575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POP1Q99575 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POP1Q99575 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POP1Q99575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POP1Q99575 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POP1Q99575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POP1Q99575 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POP1Q99575 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POP1Q99575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POP1Q99575 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POP1Q99575 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POP1Q99575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POP1Q99575 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
POP1Q99575 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POP1Q99575 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POP1Q99575 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POP1Q99575 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POP1Q99575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POP1Q99575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POP1Q99575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POP1Q99575 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POP1Q99575 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POP1Q99575 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POP1Q99575 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POP1Q99575 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POP1Q99575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POP1Q99575 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POP1Q99575 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POP1Q99575 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POP1Q99575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POP1Q99575 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POP1Q99575 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POP1Q99575 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POP1Q99575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POP1Q99575 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POP1Q99575 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POP1Q99575 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POP1Q99575 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POP1Q99575 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POP1Q99575 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POP1Q99575 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POP1Q99575 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POP1Q99575 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POP1Q99575 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POP1Q99575 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POP1Q99575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POP1Q99575 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POP1Q99575 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POP1Q99575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POP1Q99575 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POP1Q99575 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POP1Q99575 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POP1Q99575 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1001.7 ms