Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD180Q99467 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD180Q99467 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD180Q99467 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD180Q99467 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD180Q99467 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD180Q99467 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD180Q99467 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD180Q99467 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD180Q99467 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD180Q99467 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD180Q99467 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD180Q99467 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD180Q99467 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD180Q99467 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD180Q99467 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD180Q99467 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD180Q99467 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD180Q99467 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD180Q99467 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD180Q99467 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD180Q99467 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD180Q99467 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD180Q99467 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD180Q99467 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD180Q99467 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD180Q99467 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD180Q99467 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD180Q99467 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD180Q99467 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD180Q99467 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD180Q99467 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD180Q99467 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD180Q99467 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD180Q99467 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD180Q99467 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD180Q99467 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD180Q99467 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD180Q99467 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD180Q99467 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD180Q99467 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD180Q99467 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD180Q99467 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD180Q99467 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD180Q99467 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD180Q99467 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD180Q99467 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms