Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCBPQ99417 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYCBPQ99417 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCBPQ99417 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYCBPQ99417 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCBPQ99417 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCBPQ99417 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCBPQ99417 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCBPQ99417 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCBPQ99417 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms