Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HHIPQ96QV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHIPQ96QV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HHIPQ96QV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHIPQ96QV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms