Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC115Q96NT0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC115Q96NT0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC115Q96NT0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC115Q96NT0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms