Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFXN2Q96NB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN2Q96NB2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN2Q96NB2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms