Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF641Q96N77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF641Q96N77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF641Q96N77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF641Q96N77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF641Q96N77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF641Q96N77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF641Q96N77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms