Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRRC1Q96M27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRRC1Q96M27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRRC1Q96M27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms