Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170P1Q96L14 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP170P1Q96L14 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170P1Q96L14 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP170P1Q96L14 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP170P1Q96L14 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms