Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRIP1Q96KN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRIP1Q96KN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms