Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCED1BQ96HM7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCED1BQ96HM7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCED1BQ96HM7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCED1BQ96HM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCED1BQ96HM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCED1BQ96HM7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms