Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEIL1Q96FI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEIL1Q96FI4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEIL1Q96FI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms