Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
L3HYPDHQ96EM0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
L3HYPDHQ96EM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
L3HYPDHQ96EM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L3HYPDHQ96EM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L3HYPDHQ96EM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 962 ms