Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC5Q96DU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PABPC5Q96DU9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PABPC5Q96DU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PABPC5Q96DU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms