Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC127Q96BQ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC127Q96BQ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms