Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN23Q96B33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN23Q96B33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN23Q96B33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN23Q96B33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms