Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB7BQ96AH8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB7BQ96AH8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB7BQ96AH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB7BQ96AH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms