Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MKL1Q969V6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MKL1Q969V6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MKL1Q969V6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKL1Q969V6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKL1Q969V6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms