Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2E3Q969T4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2E3Q969T4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2E3Q969T4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2E3Q969T4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2E3Q969T4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms