Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF4BQ92750 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF4BQ92750 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF4BQ92750 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TAF4BQ92750 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF4BQ92750 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF4BQ92750 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TAF4BQ92750 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4BQ92750 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4BQ92750 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4BQ92750 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF4BQ92750 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF4BQ92750 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF4BQ92750 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF4BQ92750 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF4BQ92750 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms