Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHF3Q92576 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF3Q92576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF3Q92576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF3Q92576 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms