Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS9Q8WXC6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS9Q8WXC6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.8 ms