Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HELQQ8TDG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELQQ8TDG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HELQQ8TDG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HELQQ8TDG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms