Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDX54Q8TDD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
DDX54Q8TDD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DDX54Q8TDD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
DDX54Q8TDD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
DDX54Q8TDD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms