Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KLHDC4Q8TBB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KLHDC4Q8TBB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KLHDC4Q8TBB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KLHDC4Q8TBB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
KLHDC4Q8TBB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms