Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf43Q8TAL5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf43Q8TAL5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf43Q8TAL5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms