Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBOF1Q8ND07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBOF1Q8ND07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBOF1Q8ND07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BBOF1Q8ND07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBOF1Q8ND07 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOF1Q8ND07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms