Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM229BQ8NBD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM229BQ8NBD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM229BQ8NBD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms