Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNTD1Q8N9Z9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms