Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAIQ8N9R8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAIQ8N9R8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAIQ8N9R8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAIQ8N9R8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms