Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC4Q8N9L1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC4Q8N9L1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC4Q8N9L1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC4Q8N9L1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC4Q8N9L1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC4Q8N9L1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZIC4Q8N9L1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC4Q8N9L1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms