Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGP1Q8N7R0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGP1Q8N7R0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NANOGP1Q8N7R0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms