Protein–RNA interactions for Protein: Q8N720

ZNF655, Zinc finger protein 655, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF655Q8N720 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF655Q8N720 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF655Q8N720 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF655Q8N720 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF655Q8N720 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms