Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD4AQ8N468 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD4AQ8N468 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD4AQ8N468 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFSD4AQ8N468 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms