Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4BQ8IWT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN4BQ8IWT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN4BQ8IWT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms