Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREML1Q86YW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TREML1Q86YW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TREML1Q86YW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms