Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI3

NLRC5, Protein NLRC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC5Q86WI3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRC5Q86WI3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRC5Q86WI3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRC5Q86WI3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRC5Q86WI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC5Q86WI3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms