Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP13Q86W25 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NLRP13Q86W25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP13Q86W25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP13Q86W25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP13Q86W25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NLRP13Q86W25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms