Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM200AQ86VY9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM200AQ86VY9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM200AQ86VY9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms