Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD3Q86TU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD3Q86TU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD3Q86TU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD3Q86TU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD3Q86TU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms