Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J4

FGD2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2Q7Z6J4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD2Q7Z6J4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD2Q7Z6J4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD2Q7Z6J4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD2Q7Z6J4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms