Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HS2ST1Q7LGA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HS2ST1Q7LGA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HS2ST1Q7LGA3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HS2ST1Q7LGA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HS2ST1Q7LGA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms