Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PREX2Q70Z35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PREX2Q70Z35 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PREX2Q70Z35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PREX2Q70Z35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PREX2Q70Z35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PREX2Q70Z35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms