Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP30Q70CQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP30Q70CQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP30Q70CQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP30Q70CQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms