Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAXIP1Q6ZW49 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PAXIP1Q6ZW49 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PAXIP1Q6ZW49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXIP1Q6ZW49 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXIP1Q6ZW49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms